RAZNOVRSNOST PRODUŽENIH HAPLOTIPOVA GENA HLA-B*27 U HRVATSKOJ

Marijana Škifić, Katarina Štingl, Renata Žunec, Zorana Grubić

In the present study the extended haplotypes of HLA-B*27 gene were analysed in the sample of 42 Croatian families. Peripheral blood (2ml) was collected from all the individuals and genomic DNA was extracted using a commercial kit. The HLA alleles were determined using the method PCR sequence specific primers (PCR-SSP) while the microsatellite alleles were amplified using the method PCR-STR. Analysis of HLAA-B*27-D6S2927 STR_MICA-TNFa-DRB1 extended haplotypes demonstrated the strongest linkage disequilibrium between HLA-B*27 alleles and microsatellite alleles D6S2927-1 and STR_MICA-A4. Analysis indicated that the rare allele B*2730 is always present in the extended haplotype HLA-A3-B*2730-D6S2927 1- STR_MICA-A4-TNFa-9-DRB1*16. The results of the present study will be applied in future studies of association between microsatellite alleles and spondyloarthropathies and contribute to a better understanding of peptide binding to HLA class I molecules, as well as other aspects of immune response.

U ovom radu analizirani su produženi haplotipovi gena HLA-B*27 na uzorku od 42 obitelji iz Hrvatske. Svim ispitanicima uzeto je 2ml periferne krvi iz koje je izolirana DNA pomoću komercijalnog kita. Aleli gena HLA-B*27 određeni su lančanom reakcijom polimerazom s početnicama specifičnim za određeni alel (PCRSSP), a aleli mikrosatelitskih lokusa D6S2927, STR_MICA i TNFa umnoženi su početnicama specifi čnima za alele mikrosatelitskih lokusa (PCR-STR). Analizom produženih haplotipova HLA-A-B*27-D6S2927-STR_MICATNFa-DRB1 utvrđena je najjača neravnoteža udruživanja između alela gena HLA-B*27 i mikrosatelitskih alela D6S2927-1 i STR_MICA-A4. Analiza je pokazala da je rijetki alel B*2730 uvijek prisutan u produženom haplotipu: HLA-A3-B*2730-D6S2927-1-STR_MICA-A4-TNFa-9- DRB1*16. Rezultati ovog rada primijenit će se u daljnjim istraživanjima povezanosti mikrosatelitskih alela i spondiloartropatija te pomoći u boljem razumijevanju vezanja peptida na molekule HLA razreda I, kao i drugih procesa koji se javljaju tijekom imunološkog odgovora.